《圣路美娜女学院》是一部围绕校园失踪谜案展开的日本动画。故事主角木岛海平年仅17岁，因去世祖父的遗言，被指定前往圣路美娜女学院担任新理事长。一个普通高中生突然成为女学院的管理者，本身就充满荒诞与反差，而更大的危机在他上任当天降临。

学院淋浴室发生学生失踪事件，随后又有学生陆续消失，平静的校园被层层诡异气氛笼罩。海平在履行理事长职责的同时，不得不面对接连不断的失踪谜团，与校内相关人员一同追查线索。随着调查深入，事件背后似乎隐藏着学院不愿示人的秘密，离奇古怪的剧情由此逐步展开。

作品以校园悬疑为主线，融合神秘与轻喜剧元素，通过海平的视角展现他在陌生环境中应对危机、探寻真相的过程，失踪事件的连锁反应与学院暗藏的谜题构成主要看点。