《无罪的维纳斯》以一场全球性灾难为起点：公元2010年，超级飓风席卷世界，80亿人口骤减至50亿，北美、俄罗斯和北欧被冰雪封锁，大片平原沉入海底，世界经济与军事均衡随之崩溃，混沌时代就此开启。日本政府通过建立各地经济特区，勉强维持复兴局面。

故事聚焦于一群驾驶特殊装甲的少女战士，她们在灾后重组的秩序中执行危险任务，对抗神秘敌人。随着战斗推进，她们逐渐触及“维纳斯”计划背后的秘密——那既是拯救世界的钥匙，也可能带来新的灾难。作品融合末世科幻、机甲战斗与少女群像，探讨在崩坏世界中何为“无罪”，以及人类重生的代价。