《乃木坂春香的秘密第二季》延续第一季的校园恋爱喜剧风格，围绕普通高中生绫濑裕人与完美大小姐乃木坂春香之间的秘密恋情展开。裕人偶然得知了春香不为人知的一面，两人因此拉近距离。第二季中，裕人与春香的感情进一步升温，约会、校园活动等日常桥段充满甜蜜与笑料。

与此同时，春香的妹妹乃木坂美夏以及身边的朋友们继续制造各种误会与麻烦，让裕人的每一天都热闹非凡。动画以轻松幽默的节奏描绘少年少女青涩而真挚的心动，展现了平凡男生与校园偶像之间跨越身份差距的纯真感情，是典型的校园恋爱喜剧作品。