《潘多拉的果实～科学犯罪搜查档案～Season2》延续第一季的科学悬疑风格，以一起骇人事件拉开序幕：曾是少年犯罪者的交通引导员别所突然凶性大发，凭借超乎常人的怪力残忍杀害5人，随后竟如力竭般当场毙命。这起看似无解的异常案件，成为科学犯罪搜查班的新挑战。

室长小比类卷（藤冈靛饰）带领团队展开调查，顾问天才科学家最上（岸井雪乃饰）从科学角度剖析别所异变的根源，刑警长谷部（中山裕介饰）则负责追踪案件背后的人际关系与社会脉络。三人各司其职，在理性与感性之间寻找平衡。

本季继续聚焦“科学滥用”这一核心主题，每起案件都牵涉尖端科技与伦理边界。搜查班成员在破解谜团的同时，也直面自身过去的阴影与信念的动摇。别所事件只是冰山一角，随着调查深入，一个更大的阴谋逐渐浮出水面。剧集节奏紧凑，案件设计兼具推理趣味与社会派深度，探讨科学进步背后潜藏的危险与代价。