《飛常日誌》以香港國際機場為核心舞台，講述機場中央控制中心值班經理楊尚偉的日常。他年少時見證啟德機場搬遷至赤鱲角的歷史時刻，廿五年後，機場客運量攀升三倍，他背負更沉重的責任，日夜監察航班起降、天氣變化與突發事故，確保這座國際樞紐暢順運作。

港灣航空駐機場主管張若玲是楊尚偉的重要夥伴，二人性格迥異卻默契十足。從航班延誤、旅客衝突到緊急醫療事故，他們率領前線團隊逐一化解危機。劇集細膩刻畫機場各部門的協作，包括地勤、空管、保安與航空公司職員，呈現鏡頭背後不為人知的專業堅持與壓力。

除了工作上的挑戰，角色們亦面對個人情感與家庭掙扎。楊尚偉在事業與生活間尋求平衡，張若玲則在男性主導的航空界力爭上游。透過一個個真實感強烈的個案，劇集交織出人情冷暖，讓觀眾看見這座城市命脈背後，無數無名英雄的付出與溫度。